2017 januari examen

MONDELING

Vraag 1

Beschrijf het productieproces van Champagne

Vraag 2

BIOFILMS

a) Eigenschappen, samenstelling, ...

b) Hoe kan onderzocht worden welke soorten hierin zitten, zonder ze te isoleren? (FISH, of labeling, of ...)

SCHRIFTELIJK

Vraag 1

Industriële fermentatie: schema + diagrammen

a) Primaire en secundaire metabolieten uitleggen

b) Zijn de gevormde producten primaire of secundaire metabolieten?

c) Is dit biochemisch gezien een echte fermentatie?

Vraag 2

a) Wat zijn intrinsieke factoren? Geef 3 voorbeelden b) 2 anaërobe manieren om te incuberen

Vraag 3

Wat is de 12D procedure? voor welke organismen is dit en voor welke levensmiddelen?

Vraag 4

DEFINITIES:

a) Psychrotroof

b) Thermovent

c) Probiotica

d) Campylobacter

EXAMEN 2

HeelMONDELING

veel

Je vragen over alleswilt een beetjetransgene muis maken waarbij het humane sphingosine kinase enzym specifiek in longweefsel tot expressie wordt gebracht. Sphingosine kinase is een enzym dat belangrijk is voor de vorming van spingosine-1-fosfaat, een secundair boodschappermolecule. Bedenk een strategie om met behulp van de CRISP Cas technologie deze sphingosine kinase knock-in muis te maken. De knock-in gebeurt ter hoogte van de AAVS1 locus in het longcel-genoom.

Bespreek uw strategie in detail en van A tot Z! Denk hierbij aan:

- Hoe bekom je het sphingosine kinase gen?

- Hoe gebeurt constructie, amplificatie, transfectie, selectie en detectie?

- Vergeet niet toe te lichten hoe de CRISPR Cas techniek werkt en welke elementen essentieel zijn voor de werking ervan.

- Wat moet je doen om het humaan sphingosine kinase enzym in de long tot expressie te laten komen?

- Hoe noem je een dergelijke expressie (waarbij de expressie op een andere plaats dan normaal gebeurt)?

Doe dit aan de hand van onderstaande vectoren: pCas-Guide-AAVS1 en pAAVS1-puro-DNR. (gegeven)

TIP: ze kijkt niet naar jouw kladblad, maar luistert naar wat je zeggen hebt ^^

Vraag1SCHRIFTELIJK

Makkelijkevraag berekeningen: g, ml, M, w/v%, v/v%, ...1

FRET

a) Met welke methode kan hiermee gewerkt worden?

b) Leg dit uit aan de hand van een tekening

vraag 2

VectorAGROBACTERIE: gegevenbepaald +gen metin welkeplant RE'sbrengen

a) leg transfer hiermee uit

b) Ti-plasmide uitleggen: wat wordt er gekniptgecodeerd wordenen omwaarvoor insertdienen tedeze?

plaatsen;

c) Ishelper vector uitleggen: waarom is dit een gerichte klonering? Waarom?nodig?

Watd) betekent LB?...

Wat moet er nog extra in het medium? (Antibiotica, XGal en IPTG)

Selectie van cellen met of zonder vector (met antibioticaresistentie) en selectie van lege vector en met insert (Lac operon) uitleggen

Dus je hebt een petriplaat met Witte en blauwe kolonies. Welke stap doe je hierna? (Witte kolonie nemen en deze laten overnachten tot logfase)

vraag 3

PCR: Sense streng gegeven met 2 gedeeltes aangeduid waar een primer moetHAT

primersa) gevenHAT en= hiervan Tm bepalen...?

Fasen:b) naamAfbeelding kunnen geven, temp., Tijd en aantal cyclussenaanvullen

Waaromc) is er na een tijd geen lineair verband meer? Geef 2 factorenuitleggen

Vraagvraag 4

Digest opstellen met bepaalde restrictiesenzymen en leg jouw keuze uit. (hoeveel moet je van wat toevoegen: bv. Welke buffer + hoeveel als de stockopl. 100x is)HIS-tag

...

Vraagvraag 5

Functie SDS en NaOHDEFINITIES

vraag6a) Chimeer

SDS-page:b) welkestringent componentencontrol jeplasmide

pas

c) net voor het gieten toevoegd + of zuurstof moet weg worden gehaald en waarom?...